Интересно, а каким деянием работник причинил ущерб работодателю - тем, что безропотно получал выплачиваемые ему деньги? Не вижу никаких оснований утверждать об ущербе, причиненнм работником! Также, как и говорить о "недобросовестном поведении"! Спрашиваете с бухгалтера и директора.
А сумму неосновательного обогащения не взыскать никогда, если работник докажет, что деньги те уже проел - подробности см. Пп. 3 ст. 960 ГК