Надо почитать КоАП, я не помню, как оформляется дело в сокращённом порядке. Возможно, там и протокол. Но насколько я знаю, протокол не обжалуется, поскольку он не нарушает прав. Именно постановление нарушает права, поскольку оно возлагает обязанности.
Лучше просто жалобу на действия, а в просительной части потребуйте отменить протокол как незаконный.
Напишите обезличенную жалобу, мы тут всем миром вам ее подправим.
Ходатайство о восстановлении пропущенного срока обязательно, в мотивировке указать дату, когда вам стало известно о существовании протокола.